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Drug-Receptor Interaction of Peptidic HIV-1 Protease: The Hydrophobic Effect-I

Table 5

logP, π_d, π_r,and Δπ_drof compounds ofthe second set.

S.N.		log P											Binding Site			Catalytic Site
													Val	Ile		Asp	Thr	Gly
				Substituent-R1			Substituent-R2			Substituent-R3			π_r = 1.41	π_r = 1.8		π_r = 0.08	π_r = 0.16	π_r = 0
				log P_H	π_R1		log P_H	π_R2		log P_H	π_R3		Δπ_dr	Δπ_dr		Δπ_dr	Δπ_dr	Δπ_dr
19		5.39		3.21	2.18		5.39	0.00		5.39	0.00		0.77	0.38		2.26	2.02	-----
20		6.05		3.78	2.27		6.05	0.66		6.05	0.00		0.86	0.47		2.35	2.11	-----
21		5.16		2.59	2.57		5.16	0.00		5.78	-0.62		1.16	0.77		2.65	2.41	-----
22		6.27		3.21	3.06		6.27	0.00		6.27	0.00		1.65	1.26		3.14	2.90	-----
23		5.92		3.21	2.71		5.92	0.00		5.92	0.00		1.30	0.91		2.79	2.55	-----
24		6.09		3.21	2.88		6.09	0.00		6.09	0.00		1.47	1.08		2.96	2.72	-----
25		5.86		3.21	2.65		5.86	0.00		5.86	0.00		1.24	0.85		2.73	2.49	-----
26		4.61		3.21	1.40		4.61	0.00		4.61	0.00		0.01	0.40		1.48	1.24	-----
27		5.34		3.21	2.13		5.34	0.00		5.34	0.00		0.72	0.33		2.21	1.97	-----
28		3.21		3.21	0.00		3.21	0.00		3.21	0.00		1.41	1.80		0.08	0.16	-----
29		5.10		5.10	0.00		5.10	0.00		5.10	0.00		1.41	1.80		0.08	0.16	-----
30		4.35		3.21	1.14		4.35	0.00		4.35	0.00		0.27	0.66		1.22	0.98	-----
31		6.65		3.21	3.44		6.65	0.00		6.65	0.00		2.03	1.64		3.52	3.28	-----
32		4.46		3.21	1.25		4.46	0.00		4.46	0.00		0.16	0.55		1.33	1.09	-----
33		4.08		3.21	0.87		4.08	0.00		4.08	0.00		0.54	0.93		0.95	0.71	-----
34		5.18		3.21	1.97		5.18	0.00		5.18	0.00		0.56	0.17		2.05	1.81	-----
35		7.02		3.21	3.81		7.02	0.00		7.02	0.00		2.40	2.01		3.89	3.65	-----